Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB3IPQ96QF0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB3IPQ96QF0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms