Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms