Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBPF4Q96M43 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF4Q96M43 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF4Q96M43 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF4Q96M43 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF4Q96M43 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF4Q96M43 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF4Q96M43 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF4Q96M43 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF4Q96M43 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NBPF4Q96M43 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms