Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGBD1Q96JS3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD1Q96JS3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms