Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms