Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms