Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED3Q96IU2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED3Q96IU2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
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