Protein–RNA interactions for Protein: Q96H15

TIMD4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMD4Q96H15 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMD4Q96H15 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms