Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BORCS6Q96GS4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms