Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP36Q96EU6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms