Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms