Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4CQ96CF2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms