Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPSB1Q96BD6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPSB1Q96BD6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms