Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C6Q969F1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms