Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms