Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC4Q92889 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms