Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF4BQ92750 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF4BQ92750 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF4BQ92750 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF4BQ92750 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF4BQ92750 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF4BQ92750 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF4BQ92750 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF4BQ92750 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF4BQ92750 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF4BQ92750 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TAF4BQ92750 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF4BQ92750 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TAF4BQ92750 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF4BQ92750 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF4BQ92750 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF4BQ92750 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF4BQ92750 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF4BQ92750 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF4BQ92750 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF4BQ92750 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF4BQ92750 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF4BQ92750 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF4BQ92750 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF4BQ92750 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF4BQ92750 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TAF4BQ92750 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF4BQ92750 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF4BQ92750 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF4BQ92750 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF4BQ92750 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF4BQ92750 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF4BQ92750 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF4BQ92750 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TAF4BQ92750 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF4BQ92750 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF4BQ92750 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF4BQ92750 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF4BQ92750 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TAF4BQ92750 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF4BQ92750 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF4BQ92750 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF4BQ92750 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF4BQ92750 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF4BQ92750 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF4BQ92750 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF4BQ92750 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF4BQ92750 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF4BQ92750 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF4BQ92750 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF4BQ92750 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF4BQ92750 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF4BQ92750 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF4BQ92750 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF4BQ92750 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF4BQ92750 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF4BQ92750 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF4BQ92750 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TAF4BQ92750 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF4BQ92750 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF4BQ92750 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF4BQ92750 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TAF4BQ92750 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF4BQ92750 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF4BQ92750 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF4BQ92750 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms