Protein–RNA interactions for Protein: Q92738

USP6NL, USP6 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6NLQ92738 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms