Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HAVCR2Q8TDQ0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HAVCR2Q8TDQ0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms