Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH3

NUP43, Nucleoporin Nup43, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP43Q8NFH3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP43Q8NFH3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms