Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF397Q8NF99 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms