Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNNM3Q8NE01 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
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