Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q1

CYB561D1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561D1Q8N8Q1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms