Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00612Q8N6U2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00612Q8N6U2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00612Q8N6U2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00612Q8N6U2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00612Q8N6U2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00612Q8N6U2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00612Q8N6U2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00612Q8N6U2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00612Q8N6U2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00612Q8N6U2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00612Q8N6U2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00612Q8N6U2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00612Q8N6U2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00612Q8N6U2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00612Q8N6U2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00612Q8N6U2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00612Q8N6U2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00612Q8N6U2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00612Q8N6U2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00612Q8N6U2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms