Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMCO5AQ8N6Q1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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TMCO5AQ8N6Q1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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TMCO5AQ8N6Q1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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TMCO5AQ8N6Q1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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TMCO5AQ8N6Q1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO5AQ8N6Q1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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