Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms