Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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RNF182Q8N6D2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RNF182Q8N6D2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RNF182Q8N6D2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RNF182Q8N6D2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RNF182Q8N6D2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RNF182Q8N6D2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RNF182Q8N6D2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RNF182Q8N6D2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF182Q8N6D2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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