Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms