Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2BQ8N4Y2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2BQ8N4Y2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2BQ8N4Y2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2BQ8N4Y2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2BQ8N4Y2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2BQ8N4Y2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2BQ8N4Y2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2BQ8N4Y2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2BQ8N4Y2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2BQ8N4Y2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2BQ8N4Y2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2BQ8N4Y2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2BQ8N4Y2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2BQ8N4Y2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2BQ8N4Y2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2BQ8N4Y2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2BQ8N4Y2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2BQ8N4Y2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRACR2BQ8N4Y2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRACR2BQ8N4Y2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRACR2BQ8N4Y2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms