Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDCL2Q8N4E4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDCL2Q8N4E4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms