Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NME8Q8N427 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME8Q8N427 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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