Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PROM2Q8N271 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms