Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYCP3Q8IZU3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms