Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLF2Q8IX21 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms