Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC117Q8IWD4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC117Q8IWD4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC117Q8IWD4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC117Q8IWD4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC117Q8IWD4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC117Q8IWD4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC117Q8IWD4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC117Q8IWD4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC117Q8IWD4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC117Q8IWD4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC117Q8IWD4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC117Q8IWD4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC117Q8IWD4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC117Q8IWD4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms