Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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