Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms