Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTF1AQ7RTS3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms