Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms