Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM43BQ6ZT52 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms