Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC129Q6ZRS4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms