Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPTE2Q6XPS3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms