Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC171Q6TFL3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC171Q6TFL3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms