Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms