Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms