Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H3F3CQ6NXT2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms