Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms