Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms