Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HABP4Q5JVS0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HABP4Q5JVS0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms