Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TNNI3KQ59H18 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TNNI3KQ59H18 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI3KQ59H18 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI3KQ59H18 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI3KQ59H18 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI3KQ59H18 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI3KQ59H18 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI3KQ59H18 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI3KQ59H18 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI3KQ59H18 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI3KQ59H18 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI3KQ59H18 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI3KQ59H18 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI3KQ59H18 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI3KQ59H18 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI3KQ59H18 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms